Das Hauptamt des Landkreises Emmendingen ist als interner Dienstleister Ansprechpartner für den einzelnen Mitarbeiter bis zur Verwaltungsleitung sowie oft erste Anlaufstelle für Bürger, Stellensuchende und Geschäftspartner. In drei Fachbereichen kümmert es sich um das Funktionieren der Verwaltung. Außerdem sind dem Hauptamt die Gleichstellungsbeauftragte, das Kreisarchiv und Digitalisierung zugeordnet.